OHDSI Tool Documents

ドキュメントについて

●目的:
OHDSI ツールのセットアップ、操作をサポートするためにこのドキュメントを作成しました。

●環境:
Windows10 の環境下でこのドキュメントを作成していますが、Windows11 での動作も確認しています。

●ご意見、不具合について:
ドキュメントについて、課題、不具合等がある場合は、Github Issues にご報告ください。



Usagi

Usagi は、独自に定義した各種項目(薬品、病名など)を CONCEPT テーブルへマッピングするための補助ツールです。


WhiteRabbit & Rabbit-in-a-Hat

OMOP CDM の各リソースへマッピング支援するのが、Rabbit-in-a-Hat です。 Rabbit-in-a-Hat でマッピング作業を進めるために、White Rabbit では入力データを Rabbi-in-a-Hat で取り込み可能な形式に加工します。


Atlas

Atlas は、OMOP 共通データモデル(CDM)に変換され、標準化された観測データに対して科学的分析を実施するためのオープンソースソフトウェアツールです。 患者コホートの定義、分析設計の選択、パラメータの設定、データに対する分析手法の実行を可能にします。 Eunomia のテストデータは、Atlas の各分析の検証に役立ちます。

HADES

母集団の特性評価、母集団レベルの因果効果の推定、患者レベルの予測など、大規模な分析のための20個のオープンソース R パッケージのセットです。


各ツールドキュメントの課題は、GitHub の Issues で管理しています。(GitHub Issues について
https://github.com/RWD-data-environment-in-Hospital/Documents/issues


本資料は「医療技術実用化総合促進事業 Real World Evidence 創出のための取組み(通称:臨中ネット)」の支援を受けて作成されました。